More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2166 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  96.41 
 
 		 446 aa  772    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  97.09 
 
 		 446 aa  777    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  850    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  59.16 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  75.42 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  73.37 
 
 		 487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  64.84 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  59.62 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  57.55 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  51.23 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  42.66 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  43.39 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  46.79 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 432 aa  239  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.91 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.91 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.07 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.82 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.1 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.99 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  34.5 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.94 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.14 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  32.07 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  33.26 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  31.9 
 
 		 455 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  32.94 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  30.98 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  31.94 
 
 		 448 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.34 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  32.76 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  31.46 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.25 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.92 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.92 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.92 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.92 
 
 		 451 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  33.42 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.7 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  30.98 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.7 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.7 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  32 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  32.27 
 
 		 465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  32.12 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>