More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3120 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  872    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  59.14 
 
 		 446 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  58.6 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  59.16 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  55.61 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  59.18 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  48.68 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  58.55 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  40 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  45.74 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  39.86 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  44.63 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.07 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  36.43 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.26 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  33.82 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.52 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.17 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.29 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 449 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.33 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  34.11 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.6 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.45 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  31.33 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  33.82 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 457 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 449 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.53 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 449 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  32.7 
 
 		 579 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  34.6 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  30.89 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  30 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.97 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.6 
 
 		 448 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  31.02 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  32.8 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  31.55 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.76 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 440 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  29.3 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 443 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  31.22 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  32.42 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  30.77 
 
 		 461 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>