More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64790 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  100 
 
 		 444 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  88.69 
 
 		 487 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  73.93 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  73.59 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  74.94 
 
 		 446 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  58.1 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  58.65 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  54.72 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  59.2 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  51.79 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  51.62 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  42.63 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  43.76 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  42.08 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  47.6 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.17 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.26 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.91 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  36.74 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.48 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  34.02 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  38.35 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.18 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.85 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.68 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.5 
 
 		 465 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.78 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.78 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.78 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.78 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.78 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  32.59 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.78 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  34.52 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 449 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.23 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.75 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.4 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.92 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  31.94 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  33.57 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  32.43 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.94 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  32.19 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.9 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  32.19 
 
 		 447 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 468 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  38.06 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  32.95 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 465 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>