More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0804 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  843    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 446 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  38.44 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 444 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  32.69 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  38.06 
 
 		 487 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  37.78 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.24 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  31.88 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 487 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  31.93 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  30.88 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 463 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 465 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  29.02 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  31.02 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  30.67 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  30.67 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.67 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.67 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.67 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.67 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  27.88 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  30.67 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 447 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  32.71 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 447 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  28.47 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  29.77 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  29.07 
 
 		 433 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.92 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0649  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0060403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  29.07 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  29.07 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2484  putative 4-hydroxybenzoate transporter  31.54 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  29.07 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0097  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0077935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0891  major facilitator family transporter  31.54 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  29.56 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  30.43 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  29.92 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  29.58 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  27.92 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.54 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0894  major facilitator family transporter  31.28 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1052  4-hydroxybenzoate transporter  31.28 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  29.23 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 455 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  29.92 
 
 		 448 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0350  4-hydroxybenzoate transporter, putative  31.54 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 454 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>