More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03944 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  100 
 
 		 435 aa  837    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  55.11 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  54.81 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  50 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  50 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 447 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  50 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  49.64 
 
 		 446 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  52.12 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  51.87 
 
 		 444 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 450 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  40.19 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  33.89 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.4 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  38.86 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 453 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  30.07 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  30.9 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.2 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  31.99 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.21 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  32.87 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  31.92 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  30.88 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  30.88 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.88 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.88 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.88 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.88 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  31.77 
 
 		 446 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.62 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  30.88 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  29.5 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  31 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  29.49 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 452 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 452 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.62 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.47 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  31.1 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 452 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 452 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  29.79 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  30.17 
 
 		 579 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  30.1 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  29.38 
 
 		 448 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 447 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 447 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  29.13 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.01 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.8 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  29.38 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.76 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 442 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 440 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  30.07 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  31.38 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>