More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4243 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  869    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  39.41 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  36.93 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 453 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.18 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 468 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  33.64 
 
 		 448 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.7 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  33.41 
 
 		 448 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.41 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.62 
 
 		 461 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 453 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 457 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.92 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  32.72 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.57 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  34.19 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  34.19 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  34.19 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  34.19 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.64 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  35.91 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  31.71 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.65 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  31.94 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.9 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  34.42 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.99 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.39 
 
 		 451 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.39 
 
 		 451 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  34.46 
 
 		 464 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.39 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.39 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.39 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.39 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.99 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  29.71 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  34.22 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  34.79 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.72 
 
 		 458 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  33.17 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  35.31 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 487 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.46 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  32.72 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  36.96 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  35.46 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.83 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 454 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>