More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  100 
 
 		 445 aa  872    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  40 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  43.02 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 446 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 445 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  43.57 
 
 		 487 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  39.55 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  42.58 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  36.88 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.46 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  33.33 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.76 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  32.77 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 447 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  30 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  30.37 
 
 		 461 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  30.05 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  29.89 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  31.42 
 
 		 449 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.56 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  28.05 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  29.52 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  28.05 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 461 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  28.19 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  29.57 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.52 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  27.97 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  29.52 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  28.61 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.1 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.03 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 485 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.48 
 
 		 452 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  29 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  29.27 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  28.73 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  27.83 
 
 		 579 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>