More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17300 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
407 aa  794    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  60.41 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  63.81 
 
 
379 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  58.59 
 
 
413 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  55.81 
 
 
403 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  55.81 
 
 
403 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  55.81 
 
 
403 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  55.81 
 
 
403 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  56.52 
 
 
410 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  55.81 
 
 
403 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  55.81 
 
 
403 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  55.81 
 
 
403 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  55.96 
 
 
403 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  55.78 
 
 
406 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  53.08 
 
 
401 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  55.53 
 
 
404 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.73 
 
 
415 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.87 
 
 
404 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  54.39 
 
 
413 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.69 
 
 
423 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  53.37 
 
 
413 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.21 
 
 
401 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.47 
 
 
401 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.47 
 
 
401 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.39 
 
 
407 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.35 
 
 
411 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.13 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.35 
 
 
401 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.35 
 
 
401 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.35 
 
 
401 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  44.47 
 
 
402 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.32 
 
 
401 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.32 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.32 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.32 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.32 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  40.95 
 
 
417 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  39.11 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.92 
 
 
441 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.25 
 
 
461 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  34.55 
 
 
454 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.96 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34.87 
 
 
475 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.04 
 
 
438 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
439 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.93 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.84 
 
 
468 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
439 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
461 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.25 
 
 
449 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  33.08 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  33.33 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  32.76 
 
 
465 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
451 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
452 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  33.68 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  33.85 
 
 
452 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 
454 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  33.09 
 
 
452 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  32.85 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  32.85 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.86 
 
 
447 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.41 
 
 
452 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  33.42 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  32.38 
 
 
452 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  37.08 
 
 
457 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  33.75 
 
 
448 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  32.55 
 
 
451 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  32.55 
 
 
451 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.44 
 
 
465 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.26 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  32.26 
 
 
453 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.4 
 
 
452 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.26 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.55 
 
 
451 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  32.55 
 
 
451 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  32.55 
 
 
451 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.55 
 
 
451 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33 
 
 
454 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.26 
 
 
453 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.26 
 
 
453 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  32.55 
 
 
451 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.41 
 
 
452 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  32.94 
 
 
579 aa  176  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  31.9 
 
 
450 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 
463 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  37.1 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  31.39 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  42.73 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  33.68 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  33.42 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5044  major facilitator transporter  34.07 
 
 
425 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184912  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  35.1 
 
 
458 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.16 
 
 
449 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.42 
 
 
448 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32.06 
 
 
450 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  33.07 
 
 
446 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  34.92 
 
 
451 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  32.22 
 
 
454 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>