More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1354 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  865    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  64.25 
 
 		 446 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  64.61 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  64.84 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  55.61 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  54.67 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  63.61 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  50.72 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  50.72 
 
 		 447 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  63.04 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  44.75 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  48.23 
 
 		 435 aa  306  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 458 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  40.42 
 
 		 406 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  47.47 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 438 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.74 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.97 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  34.43 
 
 		 454 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.7 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.98 
 
 		 465 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  36.27 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.02 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  34.76 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.41 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 453 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.72 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  32.07 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  32.07 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.83 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  32.95 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.3 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  32.46 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.88 
 
 		 449 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.46 
 
 		 448 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  33.9 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  32.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  35.25 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  31.5 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.97 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.44 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.44 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.44 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.44 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.44 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.44 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.46 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  34.16 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  32.4 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>