More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2253 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  100 
 
 		 409 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  60 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  47 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  46.76 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 450 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  37.12 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  48.4 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  46.78 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  38.19 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  30.44 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  32.35 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.53 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.93 
 
 		 451 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.93 
 
 		 451 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  31.62 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.93 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.93 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.93 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.93 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  33.85 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.5 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  31.31 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  32.35 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.21 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  32.76 
 
 		 448 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  32.04 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 449 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  31.62 
 
 		 447 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 465 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.64 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  30.95 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  32.35 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 448 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  30.92 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  33.6 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  33.87 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  29.33 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  32.12 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.98 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.83 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.94 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  29.66 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  29.83 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.49 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  29.62 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.09 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.19 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  32.87 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  32.87 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  33.51 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.87 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.87 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 453 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  32.87 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.87 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.87 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.87 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>