More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0273 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  100 
 
 		 423 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  72.55 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  73.74 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  59.06 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  59.8 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  63.93 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  59.63 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  59.36 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  59.36 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.29 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.29 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.29 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  60.43 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  47.33 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.9 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.06 
 
 		 401 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  52.2 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  53.02 
 
 		 410 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  50.39 
 
 		 404 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.79 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.79 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.79 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.79 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  50.79 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  50.79 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  50.79 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.79 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.56 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.56 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.56 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.56 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.56 
 
 		 397 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  55.28 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.73 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.14 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  51.53 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.84 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  39.28 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  39.54 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.88 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  46.61 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.96 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 450 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  35.21 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.92 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.72 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  35.77 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 		 451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.72 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 461 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  36.24 
 
 		 451 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  36.24 
 
 		 451 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  36.32 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.32 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  36.32 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.32 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.21 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  35.23 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.68 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  36.08 
 
 		 451 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  35.38 
 
 		 579 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  31.58 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  36.13 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  33.25 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  31.65 
 
 		 455 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  34.96 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 454 aa  170  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.23 
 
 		 448 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  31.64 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>