More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0053 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  100 
 
 
401 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  93.52 
 
 
401 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  93.52 
 
 
401 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  92.77 
 
 
401 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  92.77 
 
 
401 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  92.77 
 
 
401 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  85.29 
 
 
401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  73.8 
 
 
415 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  81.55 
 
 
430 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  81.55 
 
 
401 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  81.55 
 
 
430 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  81.55 
 
 
430 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  82.28 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  66.67 
 
 
404 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  69.7 
 
 
407 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  60.59 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.55 
 
 
417 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.66 
 
 
411 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  49.37 
 
 
407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  52.46 
 
 
407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.87 
 
 
406 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.09 
 
 
401 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  56.7 
 
 
379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  48.97 
 
 
404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.22 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.22 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.22 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.22 
 
 
403 aa  308  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.02 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.884683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  48.96 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  48.96 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  48.96 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.96 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  49.15 
 
 
413 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.14 
 
 
413 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.72 
 
 
413 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.61 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  44.3 
 
 
420 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.18 
 
 
441 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  40.6 
 
 
417 aa  229  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  40.31 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.41 
 
 
475 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  35.42 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.73 
 
 
449 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  36.3 
 
 
454 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  37.23 
 
 
449 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.8 
 
 
452 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  37.04 
 
 
455 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.47 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.77 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.95 
 
 
452 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  36.62 
 
 
453 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  39.25 
 
 
451 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  36.62 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.75 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  36.62 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  36.75 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  35.06 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  39.52 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  39.52 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  35.6 
 
 
455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  39.52 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  35.46 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
452 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  35.46 
 
 
448 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  40.2 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  36.25 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  36.25 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  36.25 
 
 
451 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  36.25 
 
 
451 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.25 
 
 
451 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.83 
 
 
450 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.25 
 
 
451 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  36.25 
 
 
451 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  35.2 
 
 
448 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  37.22 
 
 
450 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.9 
 
 
453 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.74 
 
 
461 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  34.15 
 
 
454 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  47.01 
 
 
411 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  35.58 
 
 
448 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.83 
 
 
458 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  37.11 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
444 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.4 
 
 
438 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  31.74 
 
 
452 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.92 
 
 
458 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.94 
 
 
447 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  31.74 
 
 
452 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  36.54 
 
 
579 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.86 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.65 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  36.91 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  31.74 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  36.91 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  36.91 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  34.29 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  34.22 
 
 
455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>