More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3476 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  100 
 
 		 402 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  44.86 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  47 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  47.37 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.55 
 
 		 401 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.55 
 
 		 401 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.88 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  46.21 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.04 
 
 		 406 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  46.63 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  47.73 
 
 		 411 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  48.04 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.07 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.07 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.07 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.13 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.97 
 
 		 403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.97 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.97 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.97 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  45.71 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  45.71 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  45.71 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.71 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  46.49 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  51.52 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  46.61 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  47.32 
 
 		 413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  47.04 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.89 
 
 		 410 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  56.46 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  47.31 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  46.13 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.06 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.06 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.06 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.06 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.06 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.97 
 
 		 441 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  35.75 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 451 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 468 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.41 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.25 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.98 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  32.85 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 457 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 461 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.51 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.51 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.75 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  32.27 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 438 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.51 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.51 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.51 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.51 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.51 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  29.47 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 452 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 452 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 449 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.5 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  37.2 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  34.74 
 
 		 452 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>