More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0939 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  803    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  53.32 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.71 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  40.75 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  44.23 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  46.15 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.8 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  41.78 
 
 		 406 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.8 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  39.13 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  45.94 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.05 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  39.48 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  41.56 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  41.56 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.69 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.18 
 
 		 413 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.16 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.73 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  42.23 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  39.6 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  41.19 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  39.6 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  39.6 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  39.22 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  37.19 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  36.17 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  33.16 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.79 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.21 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.21 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.21 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  40.31 
 
 		 401 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  36.77 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  41.21 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.3 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.68 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  32.45 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.65 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  32.84 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  32.34 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 452 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  32.34 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  32.34 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  32.34 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.34 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.34 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  31.69 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.53 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  31.78 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 439 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.2 
 
 		 461 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 457 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  32.99 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  32 
 
 		 579 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.65 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>