More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5461 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  100 
 
 		 401 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  95.26 
 
 		 401 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  100 
 
 		 401 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  95.01 
 
 		 401 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  95.01 
 
 		 401 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  93.52 
 
 		 401 aa  597  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  83.54 
 
 		 401 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  74.81 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  80.05 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  80.05 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  80.05 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  80.05 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  80.76 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  65.65 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  70.05 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  59.52 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.4 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  57.25 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  48.61 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  52.22 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.48 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.27 
 
 		 401 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  55.59 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  48.1 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.96 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.96 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.96 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.96 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  48.7 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  48.7 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  48.7 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.7 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.36 
 
 		 410 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  48.18 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.17 
 
 		 413 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.03 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.31 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  44.94 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.07 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 468 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34.75 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  36.3 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.68 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.75 
 
 		 455 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.49 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 452 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  34.22 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.01 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  36.05 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  36.05 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.44 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.05 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  36.05 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.16 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.05 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  36.05 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  35.25 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  35.8 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  44.39 
 
 		 411 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.18 
 
 		 448 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.54 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.73 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.46 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.33 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.57 
 
 		 458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  36.05 
 
 		 579 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 458 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  37.76 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  35.86 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5044  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>