205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3466 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  94.9 
 
 
412 aa  692    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  94.39 
 
 
411 aa  738    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  818    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  62.56 
 
 
425 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  62.56 
 
 
425 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  45.81 
 
 
435 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 
405 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  41.71 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
437 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
437 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  44.39 
 
 
426 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  44.3 
 
 
413 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  44.3 
 
 
413 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  44.3 
 
 
413 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  44.3 
 
 
413 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  44.3 
 
 
408 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  44.42 
 
 
413 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  44.27 
 
 
418 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  43.61 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 
424 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  43.88 
 
 
413 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  43.34 
 
 
419 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  43.08 
 
 
419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  43.08 
 
 
419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
431 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
429 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  40.53 
 
 
429 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  41.41 
 
 
405 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
420 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 
429 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 
411 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
424 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
366 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  36.88 
 
 
522 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  25.07 
 
 
615 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  41.35 
 
 
544 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.19 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.19 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
435 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3232  hypothetical protein  72.97 
 
 
105 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  28.31 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 
540 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 
525 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.64 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.68 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 
521 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  24.94 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.43 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.08 
 
 
613 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
404 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.48 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  21.01 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
476 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.55 
 
 
432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  23.67 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.96 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  27.74 
 
 
412 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 
522 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 
475 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  24.34 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.92 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.55 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 
530 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  23.75 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  27.61 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.99 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
516 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 
534 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.37 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.93 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.31 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 
482 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
463 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  23.04 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  29.67 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
516 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
519 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
506 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  23.97 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  29.6 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>