79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0852 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  100 
 
 
615 aa  1228    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
424 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  27.05 
 
 
405 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  26.3 
 
 
418 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  27.6 
 
 
419 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  27.6 
 
 
419 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
411 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  28.35 
 
 
429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  27.32 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
420 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  27.37 
 
 
425 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
429 aa  117  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  28.35 
 
 
419 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
413 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
413 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
413 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
408 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
413 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
413 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  27.79 
 
 
413 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
429 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  25.34 
 
 
411 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  26.49 
 
 
412 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  24.94 
 
 
425 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
425 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
437 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
437 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  28.07 
 
 
426 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  24.8 
 
 
419 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
405 aa  97.4  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  24.46 
 
 
435 aa  95.1  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
439 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  29 
 
 
522 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
424 aa  65.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  28.67 
 
 
407 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
409 aa  57.4  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
408 aa  51.6  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.42 
 
 
424 aa  51.2  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  28.23 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
461 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
461 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  28.23 
 
 
424 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.62 
 
 
390 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.35 
 
 
394 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  28.23 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
430 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.42 
 
 
423 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.42 
 
 
423 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.61 
 
 
370 aa  47.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  29.6 
 
 
424 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.56 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
403 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  27.53 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
395 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.03 
 
 
395 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  28 
 
 
467 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.6 
 
 
424 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
525 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  35.8 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.94 
 
 
410 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  25.73 
 
 
544 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  31.58 
 
 
396 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
388 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
419 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.22 
 
 
429 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
411 aa  44.3  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5906  alpha-ketoglutarate transporter  29.09 
 
 
437 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414704  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.85 
 
 
388 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.85 
 
 
388 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
468 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 
565 aa  43.9  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  22.38 
 
 
454 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>