More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1670 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
413 aa  789    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  62.76 
 
 
427 aa  463  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1984  major facilitator superfamily MFS_1  58.45 
 
 
458 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.179831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2341  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
434 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.26 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.36 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.21 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.03 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  26.51 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  26.2 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  25.89 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  28.29 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.17 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  23.55 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  26.15 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  30.77 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  29.78 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  27.84 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  27.27 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  26.49 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  27.83 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.15 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.66 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  26.76 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  25.14 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  25.14 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  25.14 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.86 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  23.71 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  24.67 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  26.48 
 
 
424 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0498  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000266788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.62 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  24.42 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  31.95 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  34.81 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  26.48 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  26.94 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  26.48 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  22.85 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  27.05 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.2 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  25.71 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.63 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
421 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  24.35 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  22.95 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  29.73 
 
 
405 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  31.05 
 
 
433 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.25 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  24.44 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.29 
 
 
407 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  23.31 
 
 
444 aa  59.7  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.75 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  27.14 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
520 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05628  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11060)  26.6 
 
 
592 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.578894  normal  0.0253476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  22.11 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  27.47 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.11 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10920  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
571 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.047229  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.53 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  25.53 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  26.26 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  26.26 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  26.26 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  26.26 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
449 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  26.26 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.17 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.19 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  29.05 
 
 
475 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  30.1 
 
 
395 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  31.88 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  31.88 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.4 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  29.67 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>