More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2904 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  85.05 
 
 
408 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  84.26 
 
 
413 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  84.26 
 
 
413 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  84.26 
 
 
413 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  84.26 
 
 
413 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  84.26 
 
 
413 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  69.15 
 
 
418 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  59.59 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  56.72 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  58.17 
 
 
420 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  54.76 
 
 
425 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  54.73 
 
 
419 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  54.73 
 
 
419 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  54.98 
 
 
419 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  55.93 
 
 
429 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 
411 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
431 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
429 aa  302  8.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  41.93 
 
 
435 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
439 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
425 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  43.07 
 
 
425 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  43.86 
 
 
411 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  41.57 
 
 
419 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  42.53 
 
 
412 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  42.17 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
437 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
437 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  40 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
366 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  27.29 
 
 
544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  39.49 
 
 
522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  28.07 
 
 
615 aa  106  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.02 
 
 
387 aa  96.3  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.75 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.94 
 
 
394 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  23.14 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.88 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  36.21 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
415 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  32.5 
 
 
484 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  26.39 
 
 
685 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.46 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.94 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  29.07 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 
538 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  22.3 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  25.83 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  28.77 
 
 
420 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.86 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  28 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  23.38 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  28.77 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  22.68 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  29.22 
 
 
462 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.57 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.92 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  29.27 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3963  major facilitator transporter  30.6 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  26.49 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
430 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  24.82 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  25.93 
 
 
412 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  25.27 
 
 
406 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.65 
 
 
400 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  26.09 
 
 
469 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  24.74 
 
 
404 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25.93 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  25.93 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
503 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.61 
 
 
411 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  25.93 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  31.65 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  29.34 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  24.23 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2524  major facilitator transporter  30.67 
 
 
661 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  26.51 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
510 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>