239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0182 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
405 aa  785    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  57.36 
 
 
419 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  49.64 
 
 
435 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
439 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  51.23 
 
 
426 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 
437 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 
437 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  47.65 
 
 
425 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
425 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  46.73 
 
 
411 aa  328  8e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  46.48 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  45.48 
 
 
412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  45.43 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  45.01 
 
 
418 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  43.78 
 
 
413 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
424 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  43.95 
 
 
429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  42.43 
 
 
413 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  42.43 
 
 
408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  42.43 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  42.43 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  42.43 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  42.43 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  41.95 
 
 
425 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
420 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
431 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  42.29 
 
 
419 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  42.02 
 
 
419 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  42.02 
 
 
419 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 
429 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  42.24 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  29.11 
 
 
615 aa  96.7  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.62 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  34.29 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.93 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.96 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.27 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.51 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.81 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  23.55 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  22.91 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.9 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.9 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.33 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.58 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
387 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.58 
 
 
381 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  31.62 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
390 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  29.73 
 
 
406 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  26.1 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.08 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  35.51 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.14 
 
 
421 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  26.71 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.15 
 
 
399 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.18 
 
 
440 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  28.15 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  21.35 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  23.24 
 
 
405 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  23.3 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  23.92 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  27.23 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  21.64 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  29 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  21.09 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.93 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  32.22 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  26.88 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  36.25 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.93 
 
 
495 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  24.83 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.31 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  27.5 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.53 
 
 
495 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.32 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.88 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>