More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2678 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  801    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  65.55 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  64.14 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  42.11 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  32.82 
 
 		 391 aa  205  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.43 
 
 		 409 aa  106  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 391 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.47 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.83 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.6 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 410 aa  93.2  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 447 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.82 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  22.82 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.82 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.56 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.82 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  21.76 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  21.39 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.62 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.57 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  27.59 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.45 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.65 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  23.84 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  23.29 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.75 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.85 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.15 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.95 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.22 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  24.56 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  21.77 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.22 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>