More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0592 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
383 aa  737    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  60.58 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  61.44 
 
 
388 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 
391 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  33.16 
 
 
405 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
415 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  31.2 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
385 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  25.92 
 
 
393 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  25.92 
 
 
393 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
396 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  29.43 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.7 
 
 
474 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.7 
 
 
394 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
407 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
420 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.4 
 
 
409 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  26.32 
 
 
393 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
393 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  23.86 
 
 
432 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  25.34 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  23.59 
 
 
432 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  23.93 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  23.4 
 
 
432 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  25.14 
 
 
394 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  23.4 
 
 
432 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  23.59 
 
 
409 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  24.51 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.8 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  24.3 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.9 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  27.69 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  29.55 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  23.55 
 
 
423 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  34.46 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.04 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  23.55 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  23.27 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  30.46 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.53 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  25.07 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.72 
 
 
388 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.74 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.72 
 
 
388 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
392 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.35 
 
 
416 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.66 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  29.32 
 
 
403 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  26.18 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.3 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  25.13 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  33.15 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  40.59 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  30.41 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.75 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.65 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  37.42 
 
 
481 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
531 aa  82.8  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.23 
 
 
498 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.63 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.78 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.07 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  29.92 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.11 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  24.8 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  26.54 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  25.52 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  25.48 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  26.4 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.99 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.1 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.52 
 
 
485 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>