More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2333 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  796    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  796    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  68.61 
 
 
397 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  38.17 
 
 
392 aa  276  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  36.18 
 
 
400 aa  220  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  34.35 
 
 
401 aa  216  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
421 aa  215  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  32.13 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  31.11 
 
 
399 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  32.13 
 
 
399 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  32.13 
 
 
399 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  32.13 
 
 
399 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  31.88 
 
 
399 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
399 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  31.62 
 
 
399 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  31.62 
 
 
399 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
399 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
399 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  33.92 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 
390 aa  190  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  30.29 
 
 
396 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  30.29 
 
 
396 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  31.47 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  27.3 
 
 
402 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  29.09 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  28.06 
 
 
399 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  27.25 
 
 
381 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  29.72 
 
 
405 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  29.4 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  27.25 
 
 
384 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.94 
 
 
400 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  29.4 
 
 
396 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  29.4 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.5 
 
 
400 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  27.25 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.14 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  27.25 
 
 
381 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
391 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
381 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
381 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  26.72 
 
 
381 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  26.4 
 
 
400 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  27.11 
 
 
400 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  26.52 
 
 
506 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  27.15 
 
 
447 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  26.75 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  26.26 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
399 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
505 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.75 
 
 
506 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
396 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.12 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  26.92 
 
 
412 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.69 
 
 
411 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  26.46 
 
 
391 aa  106  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.88 
 
 
387 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 
410 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.04 
 
 
409 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
415 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.98 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  28.71 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
410 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  28.13 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  26.06 
 
 
370 aa  87  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  24.66 
 
 
402 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.28 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.2 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  25.15 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.29 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  23.36 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  23.59 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 
512 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 
609 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
525 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  25.84 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.5 
 
 
390 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  23.21 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.21 
 
 
390 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  23.21 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  25.33 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.21 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.27 
 
 
509 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.21 
 
 
390 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  25.19 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  23.45 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.92 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 
521 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.32 
 
 
534 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>