More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2465 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  85.61 
 
 		 396 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  99.75 
 
 		 396 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  100 
 
 		 396 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  99.75 
 
 		 405 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  85.64 
 
 		 396 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  99.49 
 
 		 396 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 399 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  37.4 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  37.4 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  37.4 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  37.4 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 399 aa  248  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  32.98 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  33.77 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  34.47 
 
 		 392 aa  231  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  33.77 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  32.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  32.72 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  32.72 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  32.72 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  32.98 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  31.07 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  31.07 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  32.64 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  32.22 
 
 		 506 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  32.39 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  31.61 
 
 		 506 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 447 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  31.09 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  31.09 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  29.67 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  30.39 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  29.11 
 
 		 400 aa  176  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  29.53 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  28.3 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  29.12 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  29.16 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  29.44 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.15 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.98 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.63 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.61 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 386 aa  89.4  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  26.06 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  25.77 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.59 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  25.19 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  25.19 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.59 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.59 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.8 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.8 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  26.17 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>