More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0879 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 395 aa  766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  43.67 
 
 		 411 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  26.15 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.66 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  25.39 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.93 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.43 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.43 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.77 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.63 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.91 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.45 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.99 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.46 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.63 
 
 		 506 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.84 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.34 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.46 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  23.31 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  30.45 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.42 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1810  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.66 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.42 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  27.62 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 528 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  22.85 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.41 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>