More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2807 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  797    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  64.14 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  61.31 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  44.33 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  35 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  32.45 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.26 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  27.42 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.53 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.61 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  21.73 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  24.88 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.11 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.11 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  28.06 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.01 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.84 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.24 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  23.99 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  24.17 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.52 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  25.28 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.14 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.53 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.53 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  22.05 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.92 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  25.43 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.77 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  21.33 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>