89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1231 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  769    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  80.87 
 
 
398 aa  639    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  74.18 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  71.43 
 
 
398 aa  568  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  29.4 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.13 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.8 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.8 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.86 
 
 
418 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.21 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  21.53 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.78 
 
 
370 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.62 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.25 
 
 
418 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
408 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2906  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0739227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  20.05 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.91 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0342  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.14 
 
 
418 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.37 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.01 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.73 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.73 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.57 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.57 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.57 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.29 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.29 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  22.89 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.29 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
522 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  30.56 
 
 
405 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1222  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
436 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
395 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.73 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  31.88 
 
 
406 aa  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
415 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.32 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
526 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.27 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.05 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.07 
 
 
409 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.13 
 
 
525 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.78 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.41 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  20.32 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  22.53 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21.93 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.93 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  21.93 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  21.93 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 
537 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.53 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.53 
 
 
539 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
466 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  26.89 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  23.14 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.94 
 
 
530 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.39 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  20.16 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  27.34 
 
 
530 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.41 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 
532 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.9 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.99 
 
 
501 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  33.64 
 
 
401 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 
505 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>