More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1982 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  846    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  80.84 
 
 
394 aa  588  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 
407 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 
400 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 
398 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
409 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
390 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
390 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
390 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
409 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
390 aa  99.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.42 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.39 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.23 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.56 
 
 
398 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
391 aa  63.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.82 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  22.92 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  22.92 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.5 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  22.92 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.26 
 
 
463 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
421 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  26.77 
 
 
432 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.25 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
443 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  27.71 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  24.06 
 
 
427 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  25.85 
 
 
415 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
437 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  27.47 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  31.33 
 
 
429 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.47 
 
 
432 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  27.15 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.81 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  26.24 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.92 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  22.66 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  31.68 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  27.15 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
219 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 
524 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.43 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  27.85 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.88 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  27.15 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  27.2 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.13 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.73 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.29 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  24.5 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  29.32 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  24.91 
 
 
418 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.52 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  25.52 
 
 
446 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
462 aa  57.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.38 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.17 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.54 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.83 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  23.55 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  23.1 
 
 
450 aa  57  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  25.87 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.62 
 
 
442 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.76 
 
 
426 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  23.16 
 
 
458 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.06 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  26.82 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.14 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  25.42 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.14 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>