More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3400 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
404 aa  764    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  74.81 
 
 
410 aa  556  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3861  major facilitator transporter  30.77 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  27.3 
 
 
437 aa  96.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  27.79 
 
 
458 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  27.79 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  27.79 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  27.79 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  26.26 
 
 
458 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  26.26 
 
 
458 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  26.26 
 
 
458 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  26.26 
 
 
458 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  25.99 
 
 
458 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  24.8 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  27.93 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  26.04 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2358  4-hydroxyphenylacetate permease  27.93 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.876442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2454  4-hydroxyphenylacetate transporter  27.54 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.564928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  26.17 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  26.05 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  27.66 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  24.42 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.77 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  25.41 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  23.99 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  26.87 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.74 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  26.09 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  27.64 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.13 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  25.54 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  24.89 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.49 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  25.98 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  25.66 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.51 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  23.45 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  27.84 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  26.39 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  25.64 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  25.41 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  23.83 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  24.93 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  26.63 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  23.86 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8308  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  28.34 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  28.34 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  25.76 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  26.2 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  27.56 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  23.86 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  28.34 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  23.06 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  24.42 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  26.01 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  23.72 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  25.27 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  25.27 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  25.27 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  25.47 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  23.54 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  23.9 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  23.28 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  25.7 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  24.87 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  23.91 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.68 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.71 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  22.99 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  23.91 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  25.26 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  25.26 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  23.97 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.1 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2371  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  23.84 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000288768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
444 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
444 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
443 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
444 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
432 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  26.25 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  26.46 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  25.07 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  29.91 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  26.25 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  26.25 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5185  major facilitator transporter  22.95 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>