More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0822 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
423 aa  821    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  61.12 
 
 
427 aa  511  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  36.3 
 
 
439 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  36.65 
 
 
441 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  36.12 
 
 
434 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  35.89 
 
 
434 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  36.12 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.27 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  36.28 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  35.04 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 
439 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  35.65 
 
 
434 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  35.88 
 
 
441 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  35.65 
 
 
434 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  35.65 
 
 
434 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  36.3 
 
 
437 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
445 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  37.66 
 
 
433 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.22 
 
 
443 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  37.26 
 
 
432 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  32.53 
 
 
441 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  33.01 
 
 
441 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  35.04 
 
 
432 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  34.31 
 
 
437 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  34.93 
 
 
434 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  34.21 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  34.45 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  34.7 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  36.21 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.06 
 
 
442 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
445 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  35.89 
 
 
434 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  35.84 
 
 
442 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  33.33 
 
 
447 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  36.08 
 
 
428 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  33.49 
 
 
455 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
440 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  36.47 
 
 
432 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 
424 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  33.49 
 
 
450 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  36.69 
 
 
432 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  33.09 
 
 
443 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  33.1 
 
 
443 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  32.67 
 
 
445 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  34.49 
 
 
439 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  35.06 
 
 
426 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  33.57 
 
 
464 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  34.79 
 
 
456 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  34.24 
 
 
441 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  36.21 
 
 
436 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  33.41 
 
 
440 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
444 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
452 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  34.95 
 
 
449 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  34.78 
 
 
442 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
433 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  33.89 
 
 
448 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  33.89 
 
 
448 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  32.39 
 
 
443 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
441 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
441 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  34.64 
 
 
443 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  33.33 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  35.54 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  35.63 
 
 
433 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  33.99 
 
 
441 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  33.87 
 
 
442 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
430 aa  223  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
443 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  33.33 
 
 
441 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  33.65 
 
 
459 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  33.33 
 
 
441 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
449 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  33.99 
 
 
441 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  34.75 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  34.78 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  34.52 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  34.52 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  32.85 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  33.33 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  34.52 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  37.68 
 
 
437 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  35.89 
 
 
445 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  33.67 
 
 
459 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  33.64 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  36.01 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 
444 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  36.73 
 
 
449 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
469 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  33.74 
 
 
440 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  33.74 
 
 
440 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  33.74 
 
 
440 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  33.74 
 
 
440 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  34.54 
 
 
453 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  35.97 
 
 
450 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  33.74 
 
 
440 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  34.46 
 
 
454 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  36.46 
 
 
459 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>