More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0407 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  822    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  60.19 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 426 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  38.07 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  37.16 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 450 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  34.92 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  34.2 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 437 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 450 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.41 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  36.56 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 434 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 445 aa  232  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  34.47 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  36.53 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  36.36 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  32.15 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  36.51 
 
 		 444 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.55 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  35.35 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  35.55 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  35.55 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  35.55 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  35.55 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  32.62 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 432 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 440 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 452 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  33.85 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  33.5 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  34.7 
 
 		 456 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  35.12 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  35.12 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 444 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  34.12 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>