More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3935 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  87.96 
 
 		 433 aa  773    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  88.19 
 
 		 433 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  860    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  60.8 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  60.8 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  60.56 
 
 		 430 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  60.8 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  60.56 
 
 		 430 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  61.1 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  59.14 
 
 		 438 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  58.91 
 
 		 438 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  52.96 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  45.28 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  38.52 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  36.24 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  38.35 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  38.34 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  39.06 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  38.8 
 
 		 435 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  36.57 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 425 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  37.25 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  37.25 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  33.25 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  33.01 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 437 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 443 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.97 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  29.07 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  30.37 
 
 		 433 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 443 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  31.39 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 450 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  30.14 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 442 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5091  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>