More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  100 
 
 
440 aa  880    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  65.94 
 
 
432 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  65.35 
 
 
432 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  64.3 
 
 
431 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  63.57 
 
 
429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  63.9 
 
 
422 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  63.24 
 
 
424 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  64.04 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  63.99 
 
 
430 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  63.75 
 
 
430 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
425 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  63.08 
 
 
425 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  63.08 
 
 
425 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  63.08 
 
 
425 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  63.68 
 
 
462 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  63.75 
 
 
430 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  61.86 
 
 
426 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  62.1 
 
 
426 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  61.86 
 
 
426 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  63.08 
 
 
425 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  62.84 
 
 
435 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  63.09 
 
 
435 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  62.75 
 
 
432 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  60.68 
 
 
426 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  60.98 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  60.19 
 
 
426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  60.68 
 
 
426 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  60.19 
 
 
426 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  60.44 
 
 
426 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  60.44 
 
 
426 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  58.91 
 
 
426 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  57.99 
 
 
423 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  36.58 
 
 
431 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
433 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
444 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  34.2 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  35.11 
 
 
443 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.82 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  34.94 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.44 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  34.94 
 
 
430 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  33.5 
 
 
432 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  35.07 
 
 
430 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  34.18 
 
 
430 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  34.18 
 
 
430 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  32.43 
 
 
438 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  32.43 
 
 
438 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  33.67 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
423 aa  194  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
439 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  29.82 
 
 
453 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  30.41 
 
 
444 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  30.07 
 
 
434 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  31.66 
 
 
427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.67 
 
 
429 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  28.61 
 
 
436 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  28.61 
 
 
436 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  28.61 
 
 
436 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  30.05 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  29.78 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  31.55 
 
 
437 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  27.76 
 
 
437 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  30.64 
 
 
446 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  30.32 
 
 
443 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  30.98 
 
 
433 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  29.48 
 
 
448 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  30.4 
 
 
442 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  29.48 
 
 
448 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  30.4 
 
 
442 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  32.11 
 
 
443 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  29.1 
 
 
434 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  29.1 
 
 
434 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  30.66 
 
 
446 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  29.48 
 
 
448 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  29.72 
 
 
435 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  29.17 
 
 
439 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  31.07 
 
 
446 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.9 
 
 
436 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  28.61 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  28.61 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  28.61 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  31.78 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  29.83 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  32.2 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
430 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
433 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  30.67 
 
 
441 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  30.22 
 
 
435 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
424 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  30.02 
 
 
433 aa  170  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  29.2 
 
 
442 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  30.31 
 
 
428 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  26.59 
 
 
436 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2381  major facilitator transporter  27.83 
 
 
442 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.411675  normal  0.855412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  30.31 
 
 
428 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
444 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
432 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>