More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1653 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  88.73 
 
 		 425 aa  733    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  88.5 
 
 		 425 aa  732    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  76.44 
 
 		 422 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 424 aa  732    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  94.6 
 
 		 426 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  88.73 
 
 		 425 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  97.18 
 
 		 426 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  96.24 
 
 		 426 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  89.67 
 
 		 426 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  88.97 
 
 		 425 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  86.71 
 
 		 429 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  85.75 
 
 		 431 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  96.71 
 
 		 426 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  99.3 
 
 		 426 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  88.73 
 
 		 425 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  96.71 
 
 		 426 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  89.91 
 
 		 426 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  76.51 
 
 		 426 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  71.91 
 
 		 432 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  72.18 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  72.05 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  69.25 
 
 		 432 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  69.74 
 
 		 432 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  70.66 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  68.71 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  68.71 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  68.4 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  64.04 
 
 		 432 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  61.19 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  62.28 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  60.68 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 428 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 430 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  37.03 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 435 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  34.27 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  34.71 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.83 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  33.41 
 
 		 440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  31.69 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 439 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  33.77 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  32.64 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 440 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  33.98 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  32.92 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  31.25 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.92 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>