More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3694 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  88.19 
 
 		 431 aa  773    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  870    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  97.46 
 
 		 433 aa  852    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  60.51 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  59.91 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  60.51 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  61.28 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  59.11 
 
 		 430 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 438 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  58.33 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  52.14 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  45.57 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 431 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  37.59 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  37.53 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  37.03 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 422 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  37.23 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 423 aa  263  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  35.48 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  38.9 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 426 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 426 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 425 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  36.55 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  32.77 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  32.94 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.41 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  31.14 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  28.07 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  29.91 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  30.34 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  30.11 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 436 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 436 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 436 aa  200  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>