More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5069 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  99.77 
 
 		 430 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  93.72 
 
 		 430 aa  813    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  96.04 
 
 		 430 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  93.49 
 
 		 430 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  93.49 
 
 		 430 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  60.8 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  60.51 
 
 		 433 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  60.28 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  56.14 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  45.3 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  35.9 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 424 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  36.65 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  36.65 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 426 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 422 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  35.51 
 
 		 425 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  36.84 
 
 		 432 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 426 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 426 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 426 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  35.95 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  35.62 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  35.36 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 434 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  32.37 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  31.57 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  35.44 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  33.64 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.59 
 
 		 439 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  31.32 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  35.27 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  33 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  31.09 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  34 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 469 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  30.4 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  30.4 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.65 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  35.65 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.65 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.65 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  35.65 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>