More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1981 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  85.55 
 
 		 425 aa  720    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  84.38 
 
 		 426 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  89.04 
 
 		 424 aa  769    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  86.71 
 
 		 426 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  85.78 
 
 		 425 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  75.85 
 
 		 426 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  85.08 
 
 		 426 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  87.65 
 
 		 426 aa  735    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  85.78 
 
 		 425 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  76.43 
 
 		 422 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  86.71 
 
 		 425 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  100 
 
 		 429 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  85.55 
 
 		 425 aa  721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  86.95 
 
 		 426 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  86.48 
 
 		 426 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  86.48 
 
 		 426 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  84.62 
 
 		 426 aa  710    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  94.87 
 
 		 431 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  86.48 
 
 		 426 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  72.06 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  72.06 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  71.46 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  69.38 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  68.47 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  70.86 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  70.86 
 
 		 462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  67.29 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  70.86 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  63.31 
 
 		 432 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  61.96 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  63.57 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  63.53 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 444 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 444 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  37.76 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  32.6 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.21 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  33.92 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  30.95 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 444 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  33.25 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  32 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 454 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  32 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 442 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 442 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  32.07 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  32.08 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  32.38 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  30.55 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 443 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  32.43 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  30.88 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 430 aa  179  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>