More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1580 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  99.54 
 
 		 438 aa  874    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  77.63 
 
 		 435 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  880    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  58.57 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  59.14 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  58.33 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  55.66 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 444 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  40.65 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  34.05 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 424 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 423 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  35.02 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  34.72 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  32.31 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 425 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  34.53 
 
 		 425 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  32.69 
 
 		 435 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  34.53 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  32.45 
 
 		 425 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  34.13 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  33.82 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 434 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  32.43 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.83 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  34.88 
 
 		 453 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 444 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  33.09 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  30.17 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  33.33 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  33.33 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  33.33 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  33.33 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  33.09 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 430 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 437 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 445 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>