More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0353 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  100 
 
 
432 aa  863    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  79.81 
 
 
432 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  63.15 
 
 
431 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  64.41 
 
 
424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  63.31 
 
 
429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  65.35 
 
 
440 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  63.81 
 
 
422 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  64.86 
 
 
426 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  61.76 
 
 
426 aa  541  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  63.14 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  63.88 
 
 
426 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  63.14 
 
 
426 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  64.04 
 
 
426 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  63.02 
 
 
425 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  62.77 
 
 
425 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  63.02 
 
 
425 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  63.02 
 
 
425 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  63.79 
 
 
426 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  59.15 
 
 
435 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  63.26 
 
 
425 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  64.04 
 
 
426 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  63.3 
 
 
426 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  63.3 
 
 
426 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  61.63 
 
 
430 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  59.71 
 
 
435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  60.55 
 
 
426 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  60.33 
 
 
430 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  60.57 
 
 
430 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  60.33 
 
 
462 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  58.43 
 
 
432 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  59.39 
 
 
432 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  56.37 
 
 
423 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  36.24 
 
 
431 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
433 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
433 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  33.49 
 
 
428 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  34.75 
 
 
443 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  31.81 
 
 
438 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  32.18 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  32.37 
 
 
430 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  30.96 
 
 
432 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  31.81 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  31.1 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  32.37 
 
 
430 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  30.86 
 
 
430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  30.86 
 
 
430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  30.86 
 
 
430 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  29.4 
 
 
444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  30 
 
 
426 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  29.6 
 
 
453 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
435 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  30.38 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  30.32 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
444 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  32.25 
 
 
440 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  30.96 
 
 
441 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  26.01 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  30.36 
 
 
427 aa  179  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
433 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  28.61 
 
 
428 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
423 aa  176  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  29.98 
 
 
432 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.21 
 
 
429 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  30.05 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  30.24 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  28.37 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  30.39 
 
 
435 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
443 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  28.75 
 
 
437 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  28 
 
 
442 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  28 
 
 
442 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  29.59 
 
 
442 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  30.21 
 
 
442 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
439 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  32.37 
 
 
435 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  28.44 
 
 
432 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0998  major facilitator transporter  29.26 
 
 
444 aa  170  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0295824  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  32.02 
 
 
435 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  32.02 
 
 
435 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  29.35 
 
 
443 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  30.02 
 
 
432 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  28.04 
 
 
437 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  30.1 
 
 
446 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  27.02 
 
 
435 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  31.47 
 
 
454 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
444 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  26 
 
 
436 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  29.08 
 
 
434 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  30.54 
 
 
446 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  29.08 
 
 
434 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  29.08 
 
 
434 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  30.54 
 
 
446 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  26 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  26 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  29.57 
 
 
443 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>