More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0998 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0998  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  874    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0295824  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  40.95 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 440 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 439 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 440 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 439 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  40.2 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  38 
 
 		 472 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 443 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  40.68 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  40.05 
 
 		 432 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 428 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 428 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 435 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 442 aa  256  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 442 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  39.63 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 441 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  39.69 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 441 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  43.89 
 
 		 432 aa  249  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  40.45 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  38.12 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.59 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  37.59 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 445 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  43.15 
 
 		 431 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  35.02 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  37.19 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 436 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>