More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6347 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  95.07 
 
 		 426 aa  795    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  88.5 
 
 		 425 aa  733    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  88.73 
 
 		 425 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  84.31 
 
 		 431 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  75.06 
 
 		 426 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  96.48 
 
 		 426 aa  807    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  90.61 
 
 		 426 aa  764    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  99.53 
 
 		 426 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 424 aa  731    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  88.73 
 
 		 425 aa  720    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  86.48 
 
 		 429 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  90.38 
 
 		 426 aa  764    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  96.71 
 
 		 426 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  88.73 
 
 		 425 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  96.95 
 
 		 426 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  88.73 
 
 		 425 aa  733    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  76.92 
 
 		 422 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  72.18 
 
 		 435 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  72.05 
 
 		 435 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  72.15 
 
 		 432 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  70.45 
 
 		 432 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  69.73 
 
 		 432 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  69.18 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  69.27 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  69.71 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  69.18 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  63.3 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  60.95 
 
 		 423 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  62.53 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  60.44 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 430 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 430 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  36.92 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  34.12 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.92 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  33.74 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  33.02 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 444 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  32.16 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  34.29 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  32.38 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5122  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 446 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 432 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.68 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  32.2 
 
 		 440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>