More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0993 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  33.85 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  31.34 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  31.25 
 
 		 435 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  32.38 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  29.7 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.9 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  32.09 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 430 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  28.26 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  28.26 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  29.91 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 430 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  33 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  33 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  33 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  33 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  30.62 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  34.33 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  29.25 
 
 		 440 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 450 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  28.68 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  27.49 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.93 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  29.3 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  29.97 
 
 		 453 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  27.56 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5091  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3182  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5185  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  29 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5900  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5536  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  28.43 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>