More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1375 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  66.59 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  67.08 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  63.88 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  63.7 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  66.5 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  63.53 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  63.83 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  60.93 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  64.46 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  61.14 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  64.63 
 
 		 430 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  61.9 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  64.39 
 
 		 462 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 426 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  61.23 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  61.23 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  61.96 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  61.63 
 
 		 422 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  60.95 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  60.95 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  59.95 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  59.72 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  58.74 
 
 		 432 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  59.95 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  56.37 
 
 		 432 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  57.99 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  39.55 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 431 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 438 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 430 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 430 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 430 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 438 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  31.12 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  31.36 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 439 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.51 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  31.9 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 442 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  30.37 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  29.62 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 442 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 442 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 435 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 459 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>