More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2498 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  77.63 
 
 		 438 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  77.4 
 
 		 438 aa  675    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  873    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  61.14 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  61.1 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  61.28 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  53.98 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  42.86 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  32.72 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  34.81 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  35.45 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 425 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 425 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  34.2 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  33.94 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  32.18 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 426 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  32.52 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  33.82 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  33.33 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  32.69 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.66 
 
 		 439 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  32.73 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 426 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 450 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 437 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 439 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 450 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  31.7 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 459 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  29.29 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 434 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  29.92 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>