More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3377 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  93.26 
 
 		 430 aa  789    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  99.53 
 
 		 462 aa  860    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  80.51 
 
 		 432 aa  699    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  80.05 
 
 		 432 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  96.74 
 
 		 430 aa  810    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  84.94 
 
 		 435 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  87.35 
 
 		 435 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  70.71 
 
 		 422 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  72.06 
 
 		 426 aa  604  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  71.81 
 
 		 424 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  69.9 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  70.86 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  66.27 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  68.94 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  68.94 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  68 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  68 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  71.11 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  71.11 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  71.36 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  68.47 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  71.36 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  69.41 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  69.18 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  69.18 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  69.81 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  68.71 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  64.63 
 
 		 423 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  62.71 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  63.75 
 
 		 440 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  60.33 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 428 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  36.1 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 430 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  33.73 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  34.64 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  34.18 
 
 		 435 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  33.01 
 
 		 440 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 424 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  33 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.76 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  32.9 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.09 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  32.74 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  29.02 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 437 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  28.86 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  28.78 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  32.38 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  31.34 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>