More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0652 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  100 
 
 		 437 aa  876    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  37.65 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  39.54 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  39.28 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  37.38 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  36.9 
 
 		 443 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  35.6 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 440 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  37 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  37.65 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  33.49 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.98 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 437 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  37.32 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 444 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  36.6 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  36.82 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  35.73 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 443 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 435 aa  252  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  36.64 
 
 		 436 aa  249  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 428 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 437 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  32.95 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  35.95 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  33.41 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  33.41 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  33.41 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  33.41 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  33.41 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  32.94 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  35.39 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  31.97 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  32.11 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  32.11 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 454 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  32.11 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 424 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 441 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  35.9 
 
 		 469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  34.75 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  36.19 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  36.19 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  36.19 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.19 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  36.19 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  36.5 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 450 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>