More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2567 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  96.74 
 
 		 430 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  860    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  92.07 
 
 		 430 aa  776    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  80.24 
 
 		 432 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  84.47 
 
 		 435 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  96.97 
 
 		 462 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  86.86 
 
 		 435 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  80.28 
 
 		 432 aa  698    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  70.95 
 
 		 422 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  71.81 
 
 		 426 aa  601  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  69.66 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  70.8 
 
 		 424 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  70.86 
 
 		 429 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  69.03 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  67.91 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  68.87 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  68.09 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  68.09 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  70.86 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  69.93 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  70.62 
 
 		 425 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  70.86 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  68.56 
 
 		 426 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  69.5 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  69.27 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  69.27 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  69.59 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  68.4 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  64.46 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  63.18 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  64.37 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  60.82 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 431 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 444 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 444 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  37.04 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 435 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 430 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  33.96 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  35.16 
 
 		 443 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  34.02 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 426 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  32.78 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.75 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  32.99 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.59 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  29.1 
 
 		 451 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 436 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  32.11 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  33 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  28.78 
 
 		 433 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  28.54 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>