More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2290 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  841    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  66.59 
 
 		 423 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  68.26 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  68.02 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  67.92 
 
 		 432 aa  564  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  66.27 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  66.35 
 
 		 430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  64.79 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  66.27 
 
 		 462 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  67.91 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  63.59 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  63.81 
 
 		 422 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  61.96 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  61.81 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  63.57 
 
 		 426 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  61.65 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  61.89 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  61.89 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  61.3 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  61.89 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  61.8 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  61.8 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  60.82 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  62.28 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  60.55 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  62.78 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 426 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  62.28 
 
 		 426 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  58.91 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  37.05 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 435 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  32.46 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  33.09 
 
 		 435 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.38 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  31.06 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  32.55 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  29.92 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  30.62 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 443 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  31.41 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  29.52 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  30.37 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  29.81 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  29.93 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 459 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>