More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1347 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
410 aa  781    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  75.56 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3861  major facilitator transporter  29.49 
 
 
426 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  28.53 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  26.68 
 
 
443 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  26.67 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  26.88 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  26.88 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  26.88 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  26.88 
 
 
458 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.74 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  26.98 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  26.12 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  24.21 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  26.58 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.44 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  24.79 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  26.14 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  26.08 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.05 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  25 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  25 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  25 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2454  4-hydroxyphenylacetate transporter  25.9 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.564928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  24.74 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  24.27 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  25.75 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  24.8 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.79 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  24.74 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  25.77 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  23.53 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  24.74 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  24.8 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  28.42 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  28.42 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2358  4-hydroxyphenylacetate permease  26.02 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.876442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  24.87 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  24.32 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3182  major facilitator transporter  23.1 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5091  major facilitator transporter  23.1 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5185  major facilitator transporter  23.1 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  25.61 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  25.07 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  26.7 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8308  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  25.61 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  24.66 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  25.61 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.55 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  24.23 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  26.33 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  29.01 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  27.49 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  26.98 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5896  major facilitator transporter  25.43 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2181  major facilitator transporter  25.43 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2198  major facilitator transporter  25.14 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  27.3 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  25.07 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  23.88 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  26.92 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  26.92 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  25.06 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  25.45 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5498  major facilitator transporter  25.36 
 
 
455 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  24.59 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.3 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  26.56 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.3 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0967  major facilitator transporter  27.59 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  24.88 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2098  major facilitator transporter  25.07 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  25.86 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.33 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  24.04 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.96 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2220  major facilitator transporter  25.07 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.896585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  22.91 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.53 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  26.1 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  24.62 
 
 
441 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  22.64 
 
 
436 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  26.79 
 
 
467 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  24.87 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  26.15 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  23.97 
 
 
454 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>