More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2674 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  845    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  96.01 
 
 		 426 aa  796    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  60.24 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  56.94 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  56.44 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  56.94 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  58.68 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  58.47 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  58.47 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  58.47 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  58.47 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  58.47 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  58.47 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 447 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 453 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.16 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 467 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.19 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.34 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  26.26 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.81 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  26.81 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.81 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 506 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 440 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.13 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 407 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.13 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.13 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.81 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  24.87 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>